Остеопатия различает три основных системы: краниосакральная, структуральная и висцеральная

Краниосакральная остеопатия включает комплекс приёмов, направленных на диагностику и восстановление подвижности костей черепа, твёрдой мозговой оболочки, крестца, и нормализацию тока цереброспинальной жидкости (ликвора).

Краниосакральная терапия применяется в лечении головных болей, головокружений, нарушений зрения; при воспалении придаточных пазух носа (гайморитах, синуситах), шуме в ушах, снижении слуха, дисфункции височно-нижнечелюстных суставов; в комплексной терапии последствий черепно-мозговых травм.

Структуральная остеопатия направлена на поиск и устранение нарушений подвижности в опорно-двигательном аппарате, которые приводят к болям в спине и суставах.

Методы структуральной терапии высокоэффективны в лечении проявлений остеохондроза позвоночника (радикулита, люмбоишалгии, цервикалгии, межрёберной невралгии, грыжах межпозвонковых дисков), при нарушениях осанки, сколиозах, артрозах и артритах.

Висцеральная остеопатия позволяет оценить подвижность, следовательно, и функцию внутренних органов, устранить выявленные нарушения. Таким образом, висцеральная остеопатия способствует улучшению крово- и лимфообращения во внутренних органах, нормализации обмена веществ.

Методы висцеральной терапии используются в лечении заболеваний желудочно-кишечного тракта (гастрита, язвенной болезни желудка и двенадцатиперстной кишки, панкреатита, синдрома раздраженной кишки, запора, дисфункции желчевыводящих путей, холецистита и т.д.), органов дыхания (хронического бронхита, бронхиальной астмы и т.д.), мочеполовой системы (цистита, пиелонефрита, простатита, синдрома тазовых болей и т.д.), сердечно-сосудистой системы и при опущении внутренних органов.

Методы краниосакрального, структурального и висцерального остеопатического воздействия нельзя применять изолированно, так как при этом нарушается принцип целостности остеопатии: каждая часть тела зависит от других частей этого же тела. Т.е., при лечении больного органа или сустава, следует использовать остеопатическую диагностику и терапию всего тела.